Метеорит значительных размеров совершает падение на Землю, привозя с собой зловещего трёхголового дракона по имени Король Гидора. Это событие вызывает пробуждение двух других гигантских существ – Годзиллы и Родана. Они начинают уничтожать японские военные объекты и вступают в конфликт друг с другом, разрушая всё на своём пути. В это время Мотра, гигантская разумная бабочка, стремится примирить Годзиллу и Родана. Она пытается убедить их, что истинная угроза не в их взаимной борьбе, а в пришельце с другой планеты – Короле Гидоре, который намеревается уничтожить всю жизнь на Земле. Мотра показывает себя не только как мудрый посредник, но и как стратег, понимающий, что только объединив силы, они смогут противостоять настоящему врагу. Вопреки своим разногласиям и первоначальной агрессии, Годзилла и Родан, вдохновленные самоотверженностью Мотры, начинают осознавать, что совместные действия дадут им шанс спасти свой мир от разрушения.